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最近在与AI反复沟通EU标记新生RNA后进行检测的问题时，在不同的提问环境下，AI总会提到一条：点击化学中的Cu(I) 会降解 RNA。 基于AI的高智商，我觉得应该认真核实下这个细节，因为，若点击化学过程真的会对RNA造成严重降解，那么，也将会限制EU作为核苷类似物在新生RNA研究中的应用。 当我们向AI提出"点击化学对 RNA 的影响"时，它大多会给你一段很严谨的提醒：铜催化、容易产生活性氧、RNA 是怕氧化的分子、反应液要严格控制配置和加样顺序…… 这段话说得对不对？

做单细胞核转录组（snRNA-seq）、单核 ATAC（snATAC-seq）、CUT&Tag等实验的老师，大多都会在"抽核"这一步遇到过困难，比如核抽不出来、抽出来全是碎片、结团堵机、数据废掉重测……然而，实验样本宝贵、课题周期紧张，一次翻车可能就是一个季度。 今天给大家介绍一款经 上万例真实样本验证的通用型组织抽核试剂盒——Paxcell® 通用型哺乳动物组织抽核试剂盒，并正式开放限量免费试用。

社会经济地位（socioeconomic status, SES）与健康结局的关联，是流行病学中被反复验证的结论之一。低 SES 人群的感染性疾病负担更重，疫苗接种后的抗体应答与细胞免疫应答普遍弱于高 SES 人群。对这一现象的解释多集中在医疗可及性、生活方式与慢性心理压力三个层面，均属个体之外的环境因素。至于社会处境在细胞层面留下了什么可测量的痕迹，目前缺乏直接证据。 该预印本采用的思路是绕开组学，直接测量细胞的两项速率：每个免疫亚群当前合成 RNA 的速度（转录），以及合成蛋白质的速度（翻译）。测速用的两个化学探针分别标记新生 RNA 与新生蛋白，两者共用同一套点击化学反应，因而可以在同一管样本、同一张流式图上同时读出。作者随后在人群队列中比较了这两项速率在高低 SES 组之间的差异。

1988 年 EMBO Journal 的一篇论文（PMID 3053165）测了静止的人 T 细胞里 c-myc 的 mRNA。结果是三件事同时压着它的稳态水平：启动子利用率低、基因内部存在转录延伸阻滞、胞质里的 mRNA 快速降解。TCR/CD3 被激活后，PKC 和钙离子这两条通路分别通过"增加转录起始"和"解除延伸阻滞"来推高 c-myc，而这两条通路的效果，又都能被"稳定胞质 mRNA"独立放大。 也就是说，早在单细胞测序出现之前，T 细胞生物学就已经确认了一件今天仍然成立的事：稳态 mRNA 水平是"合成速率 + 暂停释放 + 降解速率"叠加后的输出量，不能直接当作转录活性来读。 近些年，T 细胞领域的几篇代谢标记工作，把这个结论推到了基因组尺度。这篇文章按已发表文献把能做的事整理成五个入口，最后再谈一个大家更关心的问题——CAR-T 研发与工艺开发。

上周碰到一个做体外卵巢组织的新生RNA成像的客户，样本没法在体注射或灌胃孵育 EU，只能离体处理。他本来已经锁定 4sU了，但是在我给他介绍EU后，我们同时想到一个问题，同为核苷类似物，EU 是不是也可以标记离体组织？ 之所以对这个问题单独写一篇内容，是因为在之前公司内部技术培训时，我得到的信息，都是EU只能插入“活的”样本的新生RNA生成。可能在技术老师的概念里，这个“活的”本身包含了“离体”但“活着”的样本，但是在我的脑海中，“活的”跟“离体”是两个概念。既然我有这个疑问，那么其他人会不会也有这个疑问呢？ 确实，我们日常讲核苷类似物，如EU、 4sU，讲"代谢标记"，总会不自觉地在前面加上两个字——活的。活细胞、活体、活组织。仿佛核苷类似物必须先住进一个"活物"里，才能借着它的代谢机器，被掺进新生的 RNA 链。于是问题变成了：一块被取出来的组织，切断了血供、脱离了神经与内分泌调控，还算不算那个"活的"？

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5-乙炔基尿苷（EU）作为尿嘧啶类似物，在转录过程中被 RNA 聚合酶直接掺入新合成的 RNA；通过生物正交 click 反应偶联生物素，即可用链霉亲和素磁珠从总 RNA 中特异性富集“新生 RNA”，再行测序（Jao & Salic, PNAS, 2008）。它测的不是细胞里“存量有多少”，而是“此刻正在合成多少”。将它与稳态转录组、蛋白组放在同一批样本中联合分析，mRNA-蛋白不一致就能被逐层拆解。