做单细胞核转录组(snRNA-seq)、单核 ATAC(snATAC-seq)、CUT&Tag等实验的老师,大多都会在"抽核"这一步遇到过困难,比如核抽不出来、抽出来全是碎片、结团堵机、数据废掉重测……然而,实验样本宝贵、课题周期紧张,一次翻车可能就是一个季度。
今天给大家介绍一款经 上万例真实样本验证的通用型组织抽核试剂盒——Paxcell® 通用型哺乳动物组织抽核试剂盒,并正式开放限量免费试用。
一、做核测序,你踩过几个坑?——来自课题组与平台的高频反馈
痛点 01 样本种类多,无法兼容
软组织好做,脑、脂肪、乳腺、纤维结缔组织却经常核产量极低。很多方案要对难处理组织单独换 buffer、加去垢剂,一个课题配好几套体系,摸索成本极高。
痛点 02 核膜破裂、DNA 释放,结团堵机
裂解太猛核就破,破核释放的基因组 DNA 让悬液"拉丝结团",40 μm 筛网过滤困难,上机直接 clog,一管宝贵的样本就此报废。
痛点 03 杂质碎片多,数据质量上不去
实体瘤、冻存样本里死细胞和碎片多,环境 RNA 污染重,最终 Fraction Reads in Cells 偏低、基因中位数难看,审稿人一问质控就心虚。
痛点 04 操作门槛高,设备依赖强
不少方案依赖超速离心、组织解离仪等贵重设备,匀浆力度、裂解时间全凭"玄学",换个人做结果就不一样,重复性成了老大难。
痛点 05 染色质构象难保全
做 ATAC、CUT&Tag 实验最怕核膜和染色质原始空间构象被破坏——转而背景升高、峰形变差,实验白做。
二、一款试剂盒,努力做到最好——针对痛点,给出对应解法
依托机械匀浆 + 温和膜裂解体系,在充分释放完整细胞核的同时保护核膜结构稳定,最大程度保留染色质原始空间构象。
✕ 组织类型多,无法兼容
✓ 通用型配方:人、小鼠、大鼠等各类哺乳动物样本均适用,兼容新鲜组织、冻存组织与细胞悬液。
✕ 核破损、结团堵机
✓ 温和体系:机械匀浆配合温和膜裂解,充分释放完整细胞核的同时有效保护核膜结构完整稳定。
✕ 杂质多、背景高
✓ 双纯化路径:支持流式分选或密度梯度离心,轻松去除碎片与杂质,纯化步骤为可选(选做)。
✕ 设备门槛高、重复性差
✓ 普通低温离心机即可:只需水平转子,离心条件仅 4℃ / 500g,无需超速离心;参数固定、步骤明确,谁来都一样。
✕ 染色质构象受损
✓ 构象保全:最大程度保留染色质原始空间构象,为 snATAC-seq、CUT&Tag 的下游质量保驾护航。
操 作 流 程
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1 |
匀浆
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2 |
过滤
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3 |
离心
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4 |
纯化(选做)
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5 |
计数
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下 游 应 用
snRNA-seq 、单细胞 ATAC-seq、Bulk ATAC-seq、CUT&Tag核蛋白组分检测、核内核酸分析、流式分选
三、数据说话:上万例样本的验证,覆盖 25+ 种组织
01 主流组织:合格率都非常高
肠道、胆管、脾脏、肾脏、肺、乳腺(小动物)、眼睛/视网膜、脂肪类、卵巢、性腺、生殖腺(睾丸等)、胎盘、髓核、、淋巴结滑膜、肌肉、筋膜、皮下瘤模型、胃癌、胰腺癌、黑色素瘤、其他实体瘤、贝类、海产类等
02 难处理样本与实测合格率
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03 小鼠脑组织 snRNA-seq 实测数据


眼见为实——即日起开放 Paxcell® 通用型哺乳动物组织抽核试剂盒:
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